De heffing die wordt opgelegd om de kosten te dekken die niet zijn toe te schrijven aan de andere taken, zoals de kosten voor waterschapsverkiezingen. Niet alle waterschappen leggen een niet taakgebonden heffing op. Waterschappen kunnen ervoor kiezen de niet taakgebonden kosten te dekken uit de watersysteemheffing en de heffing wegenbeheer. Vanaf het begrotingsjaar 2015 wordt de niet taakgebonden heffing niet meer apart opgenomen en is deze voor alle waterschappen verdisconteerd in de watersysteemheffing en de heffing wegenbeheer.